Основные направления, обсуждаемые участниками конференции, определялись следующими вопросами: оккупация Бессарабии королевской Румынией и возникновение бессарабского вопроса; борьба народов оккупированной Бессарабии за своё освобождение и воссоединение с великой Родиной; 1940 год и его роль в международных отношениях и политической жизни современности; интерпретация событий июня 1940-го в контексте создания МССР в современной историографии; народы Бессарабии и Северной Буковины в составе СССР: итоги и проблемы полувекового развития; образование МССР и утрата Приднестровьем своей первой государственности в составе Украины (МАССР); создание ПМР как историческое последствие утраты собственной государственности и восстановление справедливости, мира и безопасности в регионе.

Председатель Верховного совета Приднестровской Молдавской Республики А. В. Каминский отметил, что летом 1940 года, в ходе начавшейся Второй мировой войны, в достаточно сложной и напряжённой обстановке, сложившейся в Европе, в том числе у юго-западных границ СССР, был мирно разрешён бессарабский вопрос. Он являлся ключевой проблемой советско-румынской дипломатии в период между двумя мировыми войнами, был одновременно и территориальным, и национальным вопросом и продолжает оказывать влияние на национально-государственные процессы Карпато-Днестровского региона.

Сегодня, по прошествии 65-ти лет со дня Великой Победы, многие вопросы из истории войны и её подоплеки по-прежнему находятся в центре общественного внимания, продолжают оставаться предметом острых дискуссий. В числе таких проблем находятся и события 1940 года, которые нуждаются в обстоятельном и непредвзятом исследовании, без чего наши представления о предыстории Великой Отечественной войны будут оставаться неполными.