Члены Общества делились на действительных членов и членов-соревнователей. Количество действительных членов было ограничено первоначально тридцатью. Впоследствии, по мере расширения круга занимающихся историей, количество действительных членов увеличивалось, но даже в 1907 году оно составляло всего 86 человек.
Из-за ограничений попасть в состав действительных членов было не просто. Стаж нахождения в членах-соревнователях мог простираться до 15 и более лет. Все это свидетельствовало о высоком авторитете Общества. Фактически оно представляло собой историческую академию, а многие члены Общества по своему авторитету в ученом мире были ничем не ниже штатных членов Академии наук.
Для поощрения тех, кто не имел возможности заниматься научными трудами, но мог помочь исследованиям материально, было введено звание членов-благотворителей. Одним из первых таких членов стал купец Игнатий Ферапонтович Ферапонтов, пожертвовавший крупную сумму денег на становление Общества. Собранные пожертвования обращались на приобретение книг и рукописей, публикацию материалов.
Должностные лица Общества выполняли работы в основном на общественных началах. Их было немного: председатель, секретарь, казначей, библиотекарь и помощник библиотекаря.
