Семья – единый организм, в котором в любви и взаимопомощи живут и стар, и млад, а все домочадцы всё делают сообща, нужно ли «есть и пить, или яства варить, или печь что, и всякие приспехи делать, и всякое рукоделие, и всякое мастерство». Объединяющим началом в доме является общая молитва: «Каждый день вечером мужу с женой, с детьми и с домочадцами, кто знает грамоту — отпеть вечерню, повечерницу, полунощницу в тишине, с вниманием и смирением, с молитвою и с поклонами, петь внятно и согласно...» В домостроевской семье кроме её отца хозяина дома, всегда чувствуется незримое присутствие другого, высшего Отца. В стремлении выполнять Его заветы все члены семьи объединялись между собою. Все отношения в семье были упорядочены, определены, всё было на своих местах. Устроенный дом «Домострой» не случайно называет раем: это место, где человек отдыхает душой, где нет места злу.
Такое строение семьи снижало возможность зарождения семейные конфликтов: каждый знал свои права и обязанности, и если субординация нарушалась, остальные члены семейства одёргивали нарушителя. Выпасть из общего ансамбля было почти невозможно. Это обеспечивало целостность семьи, соблюдение традиций и устоев общества, воспитание детей в чётких правилах. Гарантом такого воспитания был отец семейства, который помимо всего прочего выполнял функцию наставника и учителя не только детей, но и всех домочадцев.
Причём «домочадцы» – совсем необязательно родственники. В домах состоятельные людей кроме домашних слуг и дворни, всегда жило много чужих людей, призреваемые хозяевами. Такое расширительное толкование «семьи» могло иметь большое воспитательное значение. Кроме того, в «Домострое» неоднократно подчёркивается, что различия в социальном положении людей не отменяют их равенства перед Богом.
Большое значение в «Домострое» отведено семейной дисциплине, её смыслу и обеспечению. Такая дисциплина построена на свободном сознании каждым своего места. При нарушении диспозиции члены семьи, в рамках существующей иерархии, должны уметь применять средства к её восстановлению. Педагогично решается в «Домострое» вопрос о похвале и наказании как способах воспитательного воздействия. Похвала должна произноситься прилюдно, а наказание осуществляться наедине. Слово «наказание», которое в тексте «Домостроя» встречается довольно часто, не всегда совпадает с его современным понимаем. В данном случае «наказание» – наставление, наказ, а не обязательно битьё палкой или розгами, как это ещё совсем недавно трактовали исследователи. Последнее средство также предлагается в «Домострое», но как крайняя мера, «если жена, или сын, или дочь слову или наставлению не внимает, и не слушается, и не боится, и не делает того, чему муж, или отец, или мать учат», которая к тому же в средневековые отношениях не быта исключительным явлением. В Англии, например, телесные наказания применялись даже в школах вплоть до XX века.
Новым было утверждение зависимости характера воспитания от врождённые особенностей ребёнка, его направленность: «По детям смотря и по возрасту, их учить рукоделию – матери дочерей, отцу сыновей, кто к чему способен, какие кому Бог возможности даст». Настаивает «Домострой» и на особой ответственности родителей за своих детей: «Если же дети согрешают по отцовскому или материнскому небрежению, о таковых грехах и ответ им держать в день Страшного суда». Хорошо воспитанные дети – это прежде всего те, которые покоят старость своих родителей. «Если же оскудеют разумом в старости отец или мать, не обесчестите их, не укоряйте, и тогда почтут вас и ваши дети; не забывайте труд отца и матери, которые о вас заботились и печалились о вас, покойте старость их и о них заботьтесь, как они о вас. Не говори: много сделал им доброго, что одеваю, кормлю и всем обеспечиваю, – это еще тебя не освобождает от сыновнего почтения...». Дружная верующая семья по «Домострою» – залог не только домашнего благоденствия, но благополучия всей жизни, её осмысленности, целенаправленности. В тексте много упоминаний о том, как грехи человеческие, между которыми особо выделены пьянство и нарушение супружеской верности, не только рушат семью, но и калечат жизнь всех домочадцев.
«Домострой» подвёл итог многовековому развитию педагогической традиции на Руси, обобщив её ценности, идеалы, способы воспитания. Духовной практике подчинялось всё остальное развитие ребёнка и взрослого. Семейные отношения строились на той же основе, что и церковные, и общественные. Принципы духовно-нравственного воспитания естественно вырастали из народных ценностных представлений. Дети видели, как родители помогают соседям, погорельцам, подают нищим, принимают странников, ухаживают за стариками, убогими, больными, трудятся с утра до вечера. Всё это оставалось в детской памяти. Личный пример родителей оказывал решающее влияние на воспитание детей.